بررسی مولکولی ژن luxa برای شناسایی باکتری های نورافشان دریای مازندران

نورتابی زیستی (بیولومینانس) واکنشی شیمیایی است که سبب نشر نور در موجودات زنده می گردد. باکتری های نورافشان، فراوان ترین موجودات نورافشان در طبیعت هستند. برای شناسایی این باکتری ها از آزمون های بیوشیمیایی استفاده می شود. بررسی مولکولی ژن luxa که توالی آن در باکتری های نورافشان متفاوت است، می تواند در تشخیص این باکتری ها مناسب باشد. در پژوهش حاضر، نتایج تعیین جنس باکتری های نورافشان بر اساس آزمون های بیوشیمیایی و نتایج حاصل از واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از پرایمر های اختصاصی luxa مقایسه شد. همچنین، نتایج توالی یابی ژن 16s rdna جدایه های نورافشان برای تأیید نتایج، بررسی شد. نمونه های آب دریای مازندران از ایستگاه های متعدد سواحل جنوبی جمع آوری شد. باکتری های نورافشان با استفاده از محیط های کشت اختصاصی swb و swa جداسازی و ویژگی های مورفولوژیکی و فیزیولوژیکی آنها تعیین گردید. پس از گروه بندی جنس های مختلف باکتری های نورافشان بر اساس توالی ژن luxa، پرایمرهای اختصاصی طراحی و سنتز شد. با استخراج نوکلئیک اسید باکتری ها، واکنش زنجیره ای پلیمراز ژن های luxa و 16s rdna انجام شد. پس از تعیین توالی ژن 16s rdna جدایه های باکتری، درخت فیلوژنی نیز رسم شد. تعداد 9 جدایه باکتریایی نورافشان از آب دریای مازندران جداسازی شد. بر اساس نتایج آزمون های بیوشیمیایی، تعداد پنج جدایه به جنس photobacterium و چهار جدایه به جنس vibrio متعلق بود. همچنین، واکنش زنجیره ای پلیمراز ژن luxa جنس های aliivibrio، photobacterium و vibrio به ترتیب با پرایمر های اختصاصی luxa1، luxa2 و luxa3 انجام شد. نتایج توالی یابی ژن 16s rdna جنس photobacterium، نشان دهنده شباهت بیش از 99 درصد این جدایه ها به گونه p. leiognathi بود. نتایج تعیین جنس بر اساس آزمون های بیوشیمیایی و بررسی مولکولی واکنش زنجیره ای پلیمراز با پرایمر های اختصاصی luxa و نیز نتایج حاصل از توالی یابی ژن 16s rdna، با یکدیگر مطابقت داشت. بنابراین، پرایمر های اختصاصی ژن luxa می تواند برای تعیین اولیه جنس باکتری های نورافشان به کار رود.